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深度解讀
超快紫外激光脈沖激發(fā)環(huán)己二烯 追蹤結構性變化上演“分子電影”
星之球激光 來源:科學之家2015-07-07 我要評論(0 )
科學家在環(huán)形氣體分子破裂和瓦解時,首次追蹤到飛秒級超速的結構性變化。環(huán)形分子在生物化學中很豐富,也是許多化合藥物的基
科學家在環(huán)形氣體分子破裂和瓦解時,首次追蹤到飛秒級超速的結構性變化。環(huán)形分子在生物化學中很豐富,也是許多化合藥物的基礎成分。該研究指明了氣體化學反應實時x射線的研究方向,這對生物過程至關重要。
美國能源部國家斯坦福直線性加速器中心(StanfordLinearAcceleratorCenter,SLAC)實驗室的研究人員編譯出這個基本的開環(huán)反應到計算機動畫序列的完整步驟,該動畫提供一個結構性變化的“分子電影”。
這個先驅性的實驗在斯坦福直線加速器中心的直線性連續(xù)加速器光源研究所(美國能源部用戶設備科學辦公室)完成,對于精確跟蹤氣體分子在化學反應中飛秒級的變化,樹立了重要的里程碑。
斯坦福直線加速器中心的科學家MikeMinitti,曾與布朗大學的PeterWebe合作過,他說道:“這顯示了直線性連續(xù)加速器光源(LinacCoherentLightSource)的一項特性:一種從未見過的化學反應方式就會在你眼前出現(xiàn)。”Minitti表示:“直線性連續(xù)加速器光源就像是一個游戲規(guī)則的改變者,它使我們在飛秒級的速度上觀察化學變化,甚至能觀察到單個原子的運動。”這種方法還適用于更復雜的分子和化學變化。
利用斯坦福直線加速器中心的X射線研究氣體中自由懸浮的分子,可以看到化學變化中的清晰結構,這是因為氣體分子幾乎不與氣體分子或結構連接。他還補充道:“直到現(xiàn)在,利用X射線研究快速的氣體分子變化仍然受到限制。”
化學運動的新審視
該研究針對由1,3-環(huán)己二烯(1,3-cyclohexadiene,CHD)組成的氣體分子,它是一個來自松樹油的小型環(huán)形有機分子。環(huán)形分子在許多生物和化學過程中扮演關鍵角色,這些反應過程實質在于化學鍵的形成和破壞。該實驗主要追蹤環(huán)形分子在兩原子間的化學鍵破壞后如何分解變成近線性分子的過程。
Minitti表示:“對于分子的展開過程,長久以來一直存在爭議。原子可以采取不同的路徑和方向。跟蹤這一點最終顯示化學反應的過程,而且可能會促使理論和模型的改進。”
分子電影的制作
在實驗中,研究人員利用超快的紫外激光脈沖啟動開環(huán)反應,以此激發(fā)環(huán)己二烯。
然后,他們又利用斯坦福直線加速器中心的X射線在不同的時間間隔內測量分子的形狀變化過程。
研究人員序對10萬多個類似頻閃燈散射x射線的測量進行了編制和排列。然后,他們與這些測量結果與計算機模擬匹配,結果揭示了在分子結構打開后的最初200分秒內最可能的分解方式。該仿真由愛丁堡大學(UniversityofEdinburgh)研究人員AdamKirrander完成,結果展示了原子的位置和運動變化過程。
動畫的每個區(qū)間時長為25飛秒,大約是電視30幀每秒速度的1.3萬億倍。
Weber表示:“這樣的分辨率對于觀察分子運動是一個巨大的進步。”
氣體樣本對于這個研究來說是理想樣本,這是因為,任意兩相鄰環(huán)己二烯分子間的間隔被減少,使得更容易區(qū)分和追蹤單個分子運動。斯坦福直線加速器中心的x射線脈沖就像臺球游戲中的母球,使分子中的電子散射至位敏探測器,它可以規(guī)劃分子中原子的位置。
Minitti表示:“本研究可以作為大分子的基準和平臺,且有助于我們研究理解更復雜、更重要的化學變化。”
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